掃描電鏡的操作相對來說較為復雜，需要經過專業培訓和經驗積累。以下是一些可能增加操作難度的因素：

樣品制備： SEM掃描電鏡對樣品的制備要求較高。樣品需要被金屬噴鍍或其他導電性處理，而且需要保持干燥，以避免在真空環境中引起水蒸氣或氣體的釋放。

真空環境： 掃描電鏡操作需要在高真空環境下進行，這要求儀器的真空系統保持良好狀態。維護和管理真空系統可能需要一定的專業知識。

電子束對樣品的影響： 高能電子束可能導致樣品表面充電、退火或損傷。操作者需要了解如何降低這些影響。

調整參數： SEM掃描電鏡操作需要調整許多參數，包括電子束的加速電壓、孔徑大小、工作距離等。這些參數的選擇取決于要研究的樣品類型。

圖像解釋： 掃描電鏡生成的圖像可能需要經驗豐富的操作者進行正確的解釋。操作者需要理解圖像中的各種特征，包括表面形貌、結構和化學成分等。

安全注意事項： SEM掃描電鏡使用高能電子束，因此需要遵循相關的輻射安全規定。操作者需要了解和遵守這些規定，確保操作的安全性。

雖然掃描電鏡的操作可能較為復雜，但經過培訓和實踐，操作者通常能夠熟練掌握儀器的使用。此外，現代SEM掃描電鏡系統通常配備了用戶友好的界面和自動化功能，以簡化操作流程。